除此之外，卡内基梅隆大学因鼓励学生打破传统学科束缚，在交叉学科(inter-disciplinary)领域探索和研究而举世闻名。学校内设有独特的跨学科项目：如Master of Science in Computational Finance （MSCF，量化金融硕士，由商学院，数学系，统计系，以及海因茨公共政策与管理学院合办，该项目在纽约有校区，常年在QuantNet金融工程项目排名中名列前三 ）、Master of Science in Computational Biology（MSCB，计算生物学硕士，由计算机学院及梅隆理学院合办）、Master of Entertainment Technology（ETC，由计算机科学学院和艺术学院共同组建的娱乐科技中心，娱乐科技硕士）、Master of Science in Music and Technology（由计算机学院和音乐学院合办）、Master of Engineering & Technology Innovation Management（工程与科技创新管理硕士），Ph.D. Program in Machine Learning（机器学习博士项目）等等，为各个领域的学生提供了广阔的训练机会。